Случайно вместо "состоящие из шести молекул гистонов" прочитала "состоящие из шерсти молекул гистонов". 😆 Гексасома – предпочтительный субстрат для ремоделера хроматина INO80.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35597239/
Ремоделеры хроматина двигают нуклеосомы вперед-назад по ДНК, а также могут снимать нуклеосомы с ДНК. Они используют энергию АТФ. Их часто подразделяют на четыре главных класса: ISWI, SWI/SNF, CHD и INO80. Ремоделеры сотрудничают между собой для правильной установки нуклеосом на промоторы и в телах генов. Интересно, что хотя in vitro Chd1, INO80 и ISW2 одинаково двигают нуклеосомы по ДНК, в живой клетке у них разные функции.
Когда говорят о функции ремоделеров, подразумевают, что они двигают именно целые нуклеосомы. Однако, во время транскрипции и репликации нуклеосомы разбираются, а потом собираются обратно. Было показано, что при транскрипции накапливаются гексасомы – неполные нуклеосомы без одного H2A-H2B димера, состоящие из шести молекул гистонов.
Ученые под руководством Гееты Нарликар определили позиции нуклеосом на ДНК методом Mnase-секвенирования, используя пекарские дрожжи дикого типа и мутанта без АТФазной субъединицы INO80. Как оказалось, INO80 позиционирует как нуклеосомы, так и гексасомы.
Исследователи реконструировали нуклеосомы и гексасомы in vitro на ДНК, и заставили INO80 их двигать. Он лучше двигал гексасомы. Для сравнения, АТФазная активность INO80 при работе с гексамомами превышала таковую при работе с нуклеосомами в 6.3 раза.
Для такой активности INO80 использовал только один кислотный участок – область на нуклеосоме, расположенную на поверхности H2A/H2B димера. Ученые спекулируют, что даже когда INO80 двигает нуклеосомы, он на короткое время снимает один из H2A/H2B димеров и делает нуклеосому похожей на гексасому (Hsieh et al., 2022).
Hsieh, L.J., Gourdet, M.A., Moore, C.M., Munoz, E.N., Gamarra, N., Ramani, V., and Narlikar, G.J. (2022). A hexasome is the preferred substrate for the INO80 chromatin remodeling complex, allowing versatility of function. Mol Cell 82, 2098-2112 e2094.